Das Direktorium fördert die innere und äußere Entwicklung der Forschungsanstalt unter angemessener Berücksichtigung der Belange aller Institute.

Das Kuratorium fördert die Entwicklung und den Ausbau der Forschungsanstalt.
Es kann Empfehlungen zu grundsätzlichen Angelegenheiten der Forschungsanstalt geben, insbesondere zum Haushaltsvoranschlag und zu langfristigen Investitionsprogrammen.

Der Verwaltungsrat berät den Hessischen Minister für Wissenschaft und Kunst in grundsätzlichen Angelegenheiten der Forschungsanstalt.

Der wissenschaftliche Beirat begleitet und begutachtet die Arbeit der Forschungsanstalt Geisenheim. Er setzt sich zusammen aus internationalen Repräsentanten führender Unternehmen, Universitäten und Forschungseinrichtungen.