Das Forschungsspektrum der Forschungsanstalt Geisenheim umfasst die Bereiche des Weinbaus, der Oenologie, der Getränketechnologie und des Gartenbaus mit einem deutlichen Schwerpunkt auf der angewandten Forschung. Hierbei werden mit bereits existierenden Methoden oder auch neu zu entwickelnden Verfahren Themenfelder bearbeitet, die der jeweiligen Kundengruppe unmittelbar und messbar nutzen. In Teilbereichen muss die Forschungsanstalt Geisenheim auch stark grundlagenorientierte Arbeiten leisten sowie eigene Methodenentwicklungen betreiben, soweit diese nicht im Rahmen universitärer Kooperationen erbracht werden können.

Die Forschungsarbeiten haben ein hohes Niveau, werden mit internationalen Partnern durchgeführt und sind denen, die an universitären Einrichtungen erbracht werden, durchaus vergleichbar. Ablesbar ist dies an zur Zeit fast 50 Doktoranden, die in den Fachgebieten der Forschungsanstalt Geisenheim betreut werden.

Die Forschungsarbeit der Forschungsanstalt Geisenheim spiegelt sich in den Publikationen wider und bildet das Forschungsspektrum und den Kundenkreis ab: der Wissenstransfer erfolgt direkt an die o.a. Fachbereiche und Berufsgruppen. Ca. 8-10% der Publikationen (bei ca. 150-190 Publikationen/Jahr) konnten in der Vergangenheit in referierten Zeitschriften veröffentlicht werden, und dies mit steigender Tendenz.

Die Forschungsschwerpunkte der Forschungsanstalt Geisenheim  orientierten sich – wie im allgemeinen in den angewandten Wissenschaften - stark am Bedarf der fachlichen Zielgruppen. Unter Berücksichtigung der zu erwartenden gravierenden Veränderungen im Bereich Agrarproduktion und Verarbeitung ergeben sich für die Forschungsanstalt nachfolgende künftige Forschungsschwerpunkte:

Klimawandel und Ressourcenmanagement
Produkt- und Prozessqualität hochwertiger Nahrungs- und Genussmittel
Steigerung der Wettbewerbsfähigkeit und Märkte